一种基于粗糙遗传算法的缩放模式双聚类分析方法

摘要：

研究了基因表达数据的缩放模式发现问题,给出了一种缩放模式双聚类评价函数,并提出了一种基于粗糙遗传算法的双聚类分析方法.该方法先以启发式算法及随机方法生成初始种群,再基于粗糙遗传算法对种群进行迭代,以达到全局优化的目的.在Yeast数据集上进行的测试表明,该算法能对启发式算法的结果进行良好的修正.生物显著性分析表明所发现的缩放模式双聚类具有生物学意义.

关键词：双聚类分析、缩放模式、粗糙遗传算法、基因表达数据

所属期刊栏目：37

分类号：TP3;TN9

资助基金：国家自然科学基金项目60475019,60775038;高等学校博士学科点专项科研基金20060247039

在线出版日期：2010-04-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：225-228