元胞自动机图的蛋白质二级结构类型预测

摘要：

蛋白质结构预测是后基因组时代的一项重要任务,蛋白质二级结构预测是蛋白质结构预测的关键步骤.利用氨基酸数字编码模型生成蛋白质序列的元胞自动机图(Cellular Automata Image,CAI),提出了一种基于灰度共生矩阵(Gray Level Co-occurrence Matrix,GLCM)提取纹理图像特征的方法.用扩大的协方差算法进行预测,仿真结果显示有较好的分类效果,Jackknife检验的预测成功率达到94.61%.

关键词：蛋白质二级结构、元胞自动机、灰度共生矩阵、K近邻算法、Jackknife测试

所属期刊栏目：46

分类号：TP391(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金the National Natural Science Foundation of China under Grant 60661001;江西省自然科学基金the Natural Science Foundation of Jiangxi Province of China under Grant 0611060

在线出版日期：2010-08-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：226-229