基于相邻频繁模式段的闭合序列模式挖掘算法

摘要：

直接对生物序列进行频繁模式挖掘会产生很多冗余模式,闭合模式更能表达出序列的功能和结构.根据生物序列的特点,提出了基于相邻闭合频繁模式段的模式挖掘算法-JCPS.首先产生闭合相邻频繁模式段,然后对这些闭合频繁模式段进行组合,同时进行闭合检测,产生新的闭合频繁模式.通过对真实的蛋白质序列家族库的处理,证明该算法能有效处理生物序列数据.

关键词：闭合模式、相邻频繁模式段、模式组合

所属期刊栏目：44

分类号：TP311(计算技术、计算机技术)

资助基金：西北工业大学研究生创新实验室资助项目06044

在线出版日期：2008-05-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：148-151