概率决策树在生物信息数据库中的一个应用

摘要：

CO(Gene Ontology)是个标准化的生物信息本体库,被广泛地用来注释基因数据库,然而由于GO结构设计上的缺陷以及目前对基因数据库注释方法多采用手工方式,再加上基因的许多特性尚未发现,使得这种注释还不完全.该文尝试用概率决策树的方法来学习得到基因和GO本体的内在联系,进而预测基因的本体注释情况,也就是预测基因的未知特性,这样就可以引导基因数据库管理员去完善,修正基因数据库的本体注释,并指导生物学家有针对性地设计试验.作为一个应用,用MGI基因数据数据库做试验,分析表明用该方法得到的预测结果准确性比较高.

关键词：机器学习、概率决策树、本体、生物信息、基因

所属期刊栏目：40

分类号：TP311.13(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金60273045;科技部专项基金2001CCA0300;上海市科技发展基金025115032

在线出版日期：2004-09-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：167-170