基于球极坐标划分的蛋白质结构相似性比较

摘要：

为了指导新药探索,减少耗费过高的实验次数,需要有一个准确、快速的分子相似性判定方法来选择待比较的分子.为此提出一种蛋白质结构相似性比较方法,使用空间球极坐标3个分量划分蛋白质所在区域,得到蛋白质基本组成元素的空间密度特征,进而判定2个蛋白质结构的相似性.实验结果表明,该方法可作为各种结构蛋白质相似性比较的辅助手段,不仅能较好地反映蛋白质分子的空间结构特征,而且还有令人满意的时间复杂性,对大分子的相似性比较及进一步分类将有重要意义.

关键词：蛋白质分子结构分析、相似性比较、球极坐标

所属期刊栏目：21

分类号：TP391(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金60673093;国家自然科学基金重点项目90715043

在线出版日期：2009-06-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：606-611