计算机辅助药物分子对接并行演化设计

摘要：

对分子对接理论作了简单介绍,建立了一个基于柔性配体分子与刚性受体分子对接的数学规划模型,将分子对接中的构象优化搜索转化为求解约束极小化问题的过程,并采用带有空间收缩的多种群并行遗传算法进行求解.在分布式存储的并行机曙光3000上模拟计算表明,该设计具有很高的并行加速比,在保证分子对接的准确性和有效性的前提下,大大提高了分子构象搜索的速度.

关键词：分子对接、结合位点、遗传算法、信息熵、并行计算

所属期刊栏目：17

分类号：O631(高分子化学（高聚物）)

资助基金：国家自然科学基金10272030;国家重点基础研究发展计划973计划19990328

在线出版日期：2005-02-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：168-173