利用生物信息分析筛选结肠癌发生潜在基因及机制

摘要：

目的 通过生物信息学的方法来分析结直肠癌发生的潜机制.方法 利用GE02R分析差异基因表达,利用DAVID分析进行富集分析.利用STRING数据库进行蛋白相互作用分析.通过TCGA数据库对核心基因进行差异验证和预后分析.结果 通过差异分析,我们得到216个差异基因.通过富集分析发现,差异基因主要和细胞粘附有关,主要位于PPAR信号通路上.蛋白相互作用分析后,我们找到了8个核心基因(IL8、SST、SPP1、 GCG、CXCL12、LPAR1、 COL1A2和MMP1)和一个模型.经过TCGA数据库验证,我们发现8个基因都存在差异,同时两个基因预后有意义.结论 找到了8个风险相关的核心基因和2个预后相关基因,这些核心基因可能可以用做结直肠癌发病预测的靶标.

关键词：结直肠癌、富集分析、模型分析、分子机制

所属期刊栏目：40

资助基金：辽宁省科学事业公益研究基金2015005002

在线出版日期：2018-10-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：257-262