民猪Haln基因部分序列片段比对分析

摘要：

为确定民猪群体中Haln基因的核苷酸序列、基因型频率及基因频率,采用PCR方法体外扩增了民猪Haln基因完整的外显子17和内含子16,17的部分序列.采用HhaⅠ内切酶对扩增产物进行了酶切多态性分析,发现民猪HalN HalN( NN)型占70.83％,HalNHaln(Nn)型占25％,HalnHaln(nn)型占4.17％;N基因频率为83.33％,n基因频率为16.67％.对所获得的序列长度为612 bp的Haln基因片段进行序列测定同源性分析.结果表明:民猪与GenBank中已收录的Haln基因的同源性为99％,所推测的氨基酸序列同源性为95％.对民猪Haln基因核苷酸序列与已知国内外11个品种猪Haln基因核苷酸序列进行比对,共检测到15个碱基突变, 在对12个品种(系)猪Haln基因进行系统发生分析时发现,民猪与藏猪的Haln基因的遗传变异最小,构成1个支系,其他各品种间Haln基因的遗传变异较接近,彼此间有交叉现象.

关键词：民猪、Haln基因、基因频率、基因型频率、遗传变异

所属期刊栏目：33

分类号：S828(家畜)

资助基金：公益性行业科研专项nyhyzx07-034;国家科技支撑计划项目2006BAD01A08-08,2008BADB2B02-05

在线出版日期：2012-03-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：687-693