基于模体中心结构的蛋白质复合物识别算法

摘要：

基于蛋白质相互作用的网络有明显模块化特征,其对预测蛋白质功能、解释特定的生物进程具有重要作用,网络模体是复杂网络演化的重要拓扑结构,其代表了复杂系统中的重要功能单元,具有进化保守性的特性,提出一种新的基于网络模体为核心节点组的蛋白质复合物识别算法.该算法根据蛋白质相互作用网络的拓扑特性,将模体作为蛋白质复合物的中心结构体,并基于中心结构体进行二层节点扩充,能准确有效地识别蛋白质复合物.并且将复合物二维网络进行三维转化,从而更直观清晰地展示复合物的结构体特征.实验结果验证了该算法的有效性及可行性.

关键词：蛋白质相互作用网络;网络模体;蛋白质复合物;中心结构体

所属期刊栏目：59

分类号：TP301.6(计算技术、计算机技术)

资助基金：吉林省教育厅"十三五"科学技术研究规划项目;吉林省发改委创新能力建设项目

在线出版日期：2021-12-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1504-1510