限域在扶手椅型SWBNNT内Lys分子手性转变的反应机理和动力学

摘要：

采用量子力学与分子力学组合的ONIOM方法,研究限域在扶手椅型单壁氮化硼纳米管(SWBNNT)内赖氨酸(Lys)分子手性转变的反应机理.采用原子中心密度矩阵传播(ADMP)分子动力学方法,研究Lys分子在SWBNNT(5,5)内手性转变反应通道入口与出口势能面上的动态反应路径,给出中间体和产物的微观动态反应图像.结果表明:随着纳米管管径的减小,限域其中的Lys分子骨架C原子间的键角明显增大;手性C上的H与氨基N的距离逐渐变小;在SWBNNT(5,5)内,通过2个基元反应Lys分子实现了手性转变;在SWBNNT(6,6)和SWBNNT(7,7)内,通过3个和4个基元反应Lys分子实现了手性转变;在SWBNNT(5,5)内,Lys分子手性转变反应决速步骤自由能垒降为最低值190.1 kJ/mol.在SWBNNT(7,7)内,决速步骤能垒与裸反应基本相同.

关键词：纳米管、赖氨酸、手性转变、ONIOM方法、密度泛函、过渡态

所属期刊栏目：55

分类号：O641(物理化学（理论化学）、化学物理学)

资助基金：吉林省自然科学基金20160101308JC

在线出版日期：2017-04-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：435-443