核盘菌子囊盘cDNA文库的构建、EST序列分析与SsMADS基因的筛选

摘要：

以核盘菌子囊盘为材料, 应用SMART(Switch Mechanism at 5′end of RNA Transcript)技术, 构建了高质量的核盘菌cDNA文库. 涂平板测定和酶切反应鉴定表明, 原始文库的滴度为4.11×105, 重组率达97.3%. 通过对文库克隆的序列测定和初步生物信息学分析, 共获得1 800条核盘菌有效表达序列标签(Expressed Sequence Tag, EST). 同源比对分析表明, 844条独立基因代表了242个已知基因, 其余602个EST为未知序列. 这242个已知基因大致可以分为3类: 78个可归属于生物学过程, 97个可归属于分子功能, 67个可归属于细胞组分. 其中, 在97个分子功能基因中筛选到1个与MADS-box具有较高同源性的基因(SsMADS), 推测可能与核盘菌的有性生殖过程有关.

关键词：核盘菌、子囊盘、cDNA文库、EST序列、SsMADS基因

所属期刊栏目：48

分类号：Q939.95(微生物学)

资助基金：国家自然科学基金30971885;国家"十一五"科技支撑计划2006BAD08A08;吉林省科技发展计划项目20060544;吉林大学农学部重大项目启动基金和吉林大学基本科研业务费项目200903376

在线出版日期：2010-09-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：694-698