普通油茶与小果油茶的叶绿体基因分子鉴定标记

摘要：

[目的]开发能够准确、便捷、快速鉴定普通油茶与小果油茶的叶绿体基因分子标记,为油茶遗传资源的挖掘与利用提供参考.[方法]基于高通量测序技术组装了普通油茶和小果油茶的叶绿体全基因组,通过比较基因组学技术寻找两者叶绿体全基因组的差异,并根据其差异来开发可用于鉴定普通油茶与小果油茶的分子标记.为验证标记的有效性,分别选取具有代表性的12 个普通油茶居群和 6 个小果油茶居群的个体,提取叶绿体全基因组,进行PCR扩增和凝胶电泳检验.[结果]组装的普通油茶与小果油茶叶绿体基因组序列全长分别为156 977、156 539 bp,两者叶绿体全基因组具有高度的保守性,但小果油茶在atpH基因与atpI基因间的非编码区存在长度为 452 bp的大片段缺失.所开发引物的PCR扩增结果表明,所有普通油茶样本均可扩增出 609 bp的条带,而小果油茶扩增出227 bp的条带,条带差异显著且稳定.[结论]使用所开发的分子标记能够稳定、便捷、精确地鉴定出普通油茶与小果油茶,但是使用时应先确定所鉴定的物种为普通油茶和小果油茶中的一种.

关键词：普通油茶、小果油茶、叶绿体全基因组、遗传分化、分子标记

所属期刊栏目：41

分类号：S601(一般性问题)

资助基金：国家自然科学基金;中国博士后科学基金

在线出版日期：2023-10-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：206-213,262