10.14067/j.cnki.1003-8981.2020.01.007
不同引种黑莓品种的遗传多样性分析
[目的]开发适于黑莓Rubus spp.的EST-SSR引物,用于品种和种质的遗传多样性评价分析.[方法]基于前期获得的黑莓转录组数据,分析得到黑莓EST-SSR分子标记,筛查符合要求的SSR序列,设计合成127对较理想的EST-SSR引物进行扩增和多态性引物筛选,利用多态性好的引物用于18个引种黑莓栽培品种的遗传多样性分析.[结果]在127对引物中有125对可扩增出条带,有特异条带且大小符合预期的引物共有50对,50对引物中有45对具多态性的引物,占引物总数的36%,多数引物扩增的位点数为2~5.使用45对引物检测18个黑莓供试品种基因组DNA的多态性,共检测到191个等位基因变异,平均每个位点有4.24个等位基因,位点多态性信息含量为0.427~0.893,平均值为0.692.多态性最好的引物为Rh121,检测到8个等位基因,其次是Rh114和Rh118,均检测到7个等位基因.18份材料的遗传相似系数为0.49~0.88,表明品种间具有较丰富的遗传差异.利用UPGMA聚类,将18份种质分为3个类群,其中四倍体和多倍体黑莓品种明显归为不同类型,四倍体黑莓分为2类,相似育种产地的品种多聚在一起,推测与其品种遗传种质成分具一定相似性有关.[结论]EST-SSR标记可应用于黑莓品种种质遗传多样性分析,目前引种黑莓种质的遗传基础相对较窄.
黑莓、EST-SSR标记、引进品种、遗传多样性
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S663.2(果树园艺)
江苏省农业科技自主创新资金项目CX[19]2013
2020-04-21(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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