柿属植物叶绿体蛋白质编码基因密码子用法

傅建敏1刘慧敏2索玉静2谭晓风1

1.国家林业局泡桐研究开发中心; 2.中南林业科技大学;

摘要：

为给后续柿属植物叶绿体基因工程研究提供基础,利用CodonW、CUSP、SPSS软件对5个柿属植物叶绿体基因组中的55条蛋白质编码基因序列进行密码子使用模式分析.结果显示,柿属植物叶绿体基因组密码子第3位碱基GC含量为26.9％～27.8％,有效密码子数在49.58～50.18之间,密码子偏好性较弱;柿叶绿体基因组不同位置的有效密码子数不同,取值范围为32.36-59.64;中性绘图分析和ENC-plot绘图分析结果表明,柿叶绿体基因组的密码子偏好性主要受选择的影响;通过高频密码子和高表达优越密码子分析相结合的方法,筛选出23个柿属植物最优密码子,且这些密码子主要以A和U碱基结尾.

关键词：柿属植物、叶绿体、密码子偏好性、最优密码子

所属期刊栏目：35

分类号：S665.2(果树园艺)

资助基金：国家科技计划十二五2013BAD14B0502

在线出版日期：2017-09-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：38-44