仁用杏花芽3个发育时期转录组表达谱研究

摘要：

为给仁用杏分子育种提供理论依据，培育仁用杏晚花新品种，通过Illumina HiSeqTM2000高通量测序——转录组测序（RNA-seq）技术，对采于花芽萌动前后3个发育时期的仁用杏花芽进行转录组测序。经组装分析获得43469条unigenes；将所得到的unigenes与基因库数据进行比较，对unigenes进行功能注释，共22874条unigenes获得功能注释，并预测出21910条unigenes蛋白编码区；将3个发育时期仁用杏花芽的花转录组通过GO功能分类，将17237条unigenes分别归类为46个GO Term；通过将所有unigenes与KOG数据库比对，共有8379条unigenes与其它植物相似，归为26类，未知功能的unigenes有409条，预测这些基因为仁用杏的新基因；通过与KEGG数据库比对，共获得6203条unigenes，参与259个代谢途径，其中与植物节律代谢通路相关的unigenes有33条。

关键词：仁用杏、花期、转录组分析、数字基因表达谱、开花途径

所属期刊栏目：34

分类号：S662.2(果树园艺)

资助基金：“十二五”科技支撑项目“仁用杏和巴旦杏高效生产关键技术研究与示范”2013BAD14B02。

在线出版日期：2016-12-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：14-19