毛蚶容量指数相关基因的转录组学研究
为筛选不同容量指数毛蚶间的差异基因,寻找毛蚶容量指数性状相关基因.选取容量指数极端值(极大值和极小值)的毛蚶闭壳肌组织进行转录组测序、生物信息分析和差异表达基因功能富集分析.结果表明:各样本转录组测序过滤后共获得20.47×106~25.44×106条有效Reads,有效Reads数据量为6.13~7.62 G,所占比例均超过99.76%;19 493条unigene注释到GO数据库,占比为37.82%;8 548条unigene注释到KEGG数据库中,占比为16.58%.通过差异表达基因功能富集分析发现了大量可能与毛蚶闭壳肌生长相关的基因.GO富集分析显示,5 243个差异基因富集到三大门类中,参与了多个生理过程,如细胞内蛋白质运输、细胞分解代谢、细胞拼接和神经闭壳肌连接处突触生长的调节过程等.391个差异基因显著富集到56 933条代谢通路,如X连锁凋亡抑制蛋白、胆囊收缩素B受体、胃动素受体、ATP-dependent RNA解旋酶、二肽基肽酶3、酸性核糖体磷酸蛋白P1、BSG单克隆抗体和核糖体小亚基蛋白S3e等参与生物的摄食与代谢,可能在毛蚶生长过程中容量指数性状的调控发挥着重要作用.
毛蚶、容量指数、转录组、生长相关基因
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S968.31(水产养殖技术)
国家重点研发计划;天津市现代产业技术体系-海水养殖-池塘生态养殖岗位;现代农业产业技术体系建设专项
2023-02-20(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共10页
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