基于生物信息学分析CCNB1、ASPM和AURKA作为肝细胞癌预后标志物的潜力

摘要：

目的 本研究基于生物信息学分析,探寻肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)发生发展的枢纽基因,为HCC患者的预后提供潜在的生物标志物.方法 从GEO数据库下载两个肝细胞癌芯片数据(GSE14520和GSE46408),通过GEO2R筛选HCC组织和正常肝组织之间的差异表达基因(DEGs).利用STRING数据库构建DEGs的蛋白质互作(PPI)网络,并用Cytoscape软件的CytoHubba插件计算PPI中各基因的连接度,筛选出枢纽基因.通过利用ONCOMINE、GEPIA2、cBioPortal、GeneMANIA、DAVID6.8和TIMER数据库对筛选出的枢纽基因进行转录、翻译、生存情况和肿瘤免疫浸润相关性等方面的验证,并分析其是否具有作为HCC预后生物标志物的潜力.结果 筛选出3个枢纽基因(CCNB1、ASPM和AUR-KA),且均在HCC中高表达.生存分析表明这3个基因均与HCC患者的总体生存率和无病生存率显著相关.肿瘤免疫浸润分析结果进一步提示CCNB1、ASPM和AURKA可能是HCC潜在的预后标志物.结论 CCNB1、ASPM和AURKA可能是HCC发生发展的枢纽基因,具有成为HCC预后标志物的潜力.

关键词：肝细胞癌、生物信息学、差异表达基因、预后标志物

所属期刊栏目：40

分类号：R735.7(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金;江西省自然科学基金;江西省卫计委课题

在线出版日期：2022-07-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：30-34,54