寨卡病毒E、NS5蛋白生物信息学分析

摘要：

目的 对寨卡病毒(ZIKV)E蛋白和NS5蛋白序列进行生物信息学比较研究,并分析其意义.方法 利用多种生物信息在线分析工具和软件包对ZIKV E、NS5基因及编码蛋白与其他黄病毒属代表株序列比对,计算核苷酸和氨基酸同源性.预测ZIKV E、NS5蛋白跨膜区、信号肽与二级结构以及B细胞表位.结果 不同地理株的ZIKV E蛋白核苷酸和氨基酸同源性分别为87.1％～100％和94.2％～100％,与黄病毒属中Spondweni病毒最接近,氨基酸同源性最高达72.8％.不同地理株的ZIKV NS5蛋白核苷酸和氨基酸同源性分别为88％～99.9％和95.5％～100％,与Spondweni病毒最接近,氨基酸同源性最高达77.5％.E蛋白二级结构以无规则卷曲居多,占50.79％,存在两个跨膜结构区域461～479aa、483～501aa,信号肽断裂位点位于501aa,可能的抗原表位区域有:317～342aa、155～181、66～89、226～238、380～384aa;NS5蛋白二级结构也以无规则卷曲居多,占51.60％,无跨膜结构区域,信号肽断裂位点位于152aa,可能的表位区域有100～114aa,、360～372、148～159、688～707aa.结论 预测到ZIKV E、NS5蛋白的基本结构特征和潜在的线性B细胞表位,为ZIKV的疫苗研究和免疫诊断试剂的研制打下基础.

关键词：寨卡病毒、E蛋白、NS5蛋白、生物信息学

所属期刊栏目：37

分类号：R373;Q811.4(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：赣州市指导性科技计划项目GZ2018ZSF192

在线出版日期：2019-12-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1031-1034