国产大蒜凝集素基因的克隆与生物信息学分析

摘要：

为了获得国产大蒜新的凝集素家族基因,根据NCBI数据库中已公布的大蒜凝集素基因序列设计引物,从国产大蒜的鳞茎中提取总RNA,采用RT-PCR技术分离克隆出一个大蒜凝集素基因,命名为ASA-C.ASA-C全长546 bp,包含1个471 bp的ORF,编码156个氨基酸的多肽.利用网站和分析软件对其进行生物信息学分析.结果表明:ASA-C与已公布的同源二聚体大蒜凝集素ASAⅡ基因具有较高同源性;推测该基因编码多肽的N端有一典型跨膜结构域的信号肽,多肽序列上有3个甘露糖特异性结合凝集素共有基序(Q-D-N-V-Y).多重序列比对以及系统进化树的结果表明大蒜凝集素的保守性很强,这为进一步开发利用大蒜凝集素蛋白的功能奠定了基础.

关键词：大蒜、凝集素基因、克隆、生物信息学分析

所属期刊栏目：51

分类号：S633.4;Q943.2(蔬菜园艺)

资助基金：湖北省豆类蔬菜植物工程技术研究中心开放基金项目;江汉大学校级科研项目

在线出版日期：2023-03-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：28-35