模拟分析EcClC通道蛋白二聚体分离的微观变化

摘要：

EcClC氯离子通道蛋白是一个同源二聚体,由两个结构相似的单体组成.根据已有的二聚体分离实验方法,运用分子动力学模拟方法,将EcClC蛋白两个单体接触面上的两个体积较小的非极性残基异亮氨酸变异为体积较大的芳香环残基色氨酸,观察整个二聚体分离的微观过程.在分离阶段,笔者分别计算了A链和B链的相互接触面积、相连的氢键个数、范德瓦尔斯势和静电势随时间的变化.结果显示这些参数随着二聚体的分离均有不同程度变化,其中,二聚体之间的接触面积随二聚体分离变化最为明显.

关键词：氯离子通道蛋白、分子动力学模拟、二聚体分离、微观过程

所属期刊栏目：46

分类号：Q51;TP391.9(蛋白质)

资助基金：国家自然科学基金资助项目11647142

在线出版日期：2018-12-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：251-256