汉滩病毒糖蛋白Gn的T细胞表位预测及其跨种属验证

摘要：

目的 筛选、鉴定并验证汉滩病毒(HTNV)包膜糖蛋白-N末端(Gn)上的免疫反应性表位.方法 通过UniProt数据库获取HTNV 76-118株Gn蛋白序列.采用IEDB、SMMPMBEC、NetMHCpan 4.1、SYFPEITHI、Rankpep算法预测表位亲和力,VaxiJen v2.0分析免疫原性,Blastp工具计算保守性,HPEPDOCK和EpiDOCK模拟pMHC对接,TBtools进行双向聚类分析,酶联免疫斑点(ELISpot)实验评价表位细胞免疫反应性.结果 通过UniProt数据库获得了HTNV 76-118株Gn蛋白序列(PRO_0000036816).整合5种亲和力算法,在小鼠H-2亚型中获得了61个优势表位,在人主要组织相容性复合物(MHC)-Ⅰ亚型中得到234个优势表位,MHC-Ⅱ亚型中得到212个优势表位;VaxiJen筛选分别获得H-2、MHC-Ⅰ、MHC-Ⅱ亚型强免疫原性优势表位23、110、42个;进一步采用Blastp筛选获得高亲和力、强免疫原性、种间种内保守的MHC-Ⅰ类限制性表位3个,MHC-Ⅱ类限制性表位81个.双向分层聚类分析揭示了小鼠H2-d、H2-b和部分人类白细胞分化抗原(HLA)在提呈HTNV Gn表位上的相似性.ELISpot验证了5个表位具有较强的诱导脾细胞分泌γ干扰素(IFN-γ)的能力.结论 预测并验证了HTNV Gn上的细胞免疫反应性表位,证实在MHC提呈中病毒抗原存在跨基因、种属、物种的交叉免疫反应性,为预防肾综合征出血热(HFRS)提供了新思路.

关键词：汉滩病毒、糖蛋白、表位、计算机预测、免疫反应性

所属期刊栏目：48

分类号：R512.8;R373.3+(传染病)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;空军军医大学提升计划课题项目

在线出版日期：2023-10-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：1000-1010