东莞市HIV-1流行株pol基因序列特征和亚型分析

摘要：

目的 了解东莞市人类免疫缺陷病毒I型(human immunodeficiency virus type 1,HIV-1)感染者的流行病学特征及亚型的分布情况.方法 选取50例样本,收集流行病学资料,采用RT-PCR法扩增pol基因序列并测序,应用BioEdit、Genotyping和MEGA等生物学软件对pol基因进行序列分析.结果 收集的50例样本最终成功扩增得到32份样本的pol基因序列,其中CRF01_AE亚型12例;CRF_07BC亚型11例;B亚型7例;CRF55_01B亚型2例.各亚型基因离散率分别为CRF01 _AE是(0.075±0.039)、CRF07_BC是(0.030±0.009)、B亚型是(0.073±0.022),各亚型之间的基因离散率差异有统计学意义(F=41.055,P＜0.001),CRF01_AE亚型和B亚型内毒株间的基因离散率均大于与CRF07_BC亚型(P值均小于0.001).结论 CRF01_AE和CRF_07BC亚型在东莞市HIV-1流行株中占优势,CRF07_BC亚型在各亚型之间的基因离散率最小.

关键词：人类免疫缺陷病毒1型、基因变异、序列分析

所属期刊栏目：22

分类号：R373.51;R342.26(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：广东省科技计划项目2014A020212458

在线出版日期：2019-01-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：1297-1299