二倍体和四倍体泥鳅IGFBP-1基因的表达及其与DNA甲基化的相关性

摘要：

为探讨胰岛素样生长因子结合蛋白-1(IGFBP-1)基因在二倍体和四倍体泥鳅之间的表达差异及其与DNA甲基化的相关性,克隆二倍体、四倍体泥鳅的CDS序列和启动子序列,并分别采用qRT-PCR和亚硫酸氢盐测序技术(BSP)分析IGFBP-1在二倍体、四倍体泥鳅中的表达水平及启动子区和第一外显子区的甲基化水平.结果显示,泥鳅的IGFBP-1基因CDS序列长789 bp,编码262个氨基酸,二倍体、四倍体泥鳅间有5 bp的差异,但氨基酸序列完全相同.在二倍体、四倍体中分别克隆得到2341 bp和2331 bp的启动子序列,倍性间的序列相似度达99％,启动子序列中包含典型元件TATA-box,以及SP1、CREB、C/EBP、POU2F2、GATA-2/3/4和S R Y等转录因子结合位点.泥鳅的IGFBP-1基因主要在肝脏中表达,且四倍体泥鳅肝脏中IGFBP-1的表达水平显著高于二倍体(P<0.01).四倍体泥鳅IGFBP-1基因启动子及第一外显子区的甲基化水平均比二倍体低,其中四倍体肝脏中的甲基化水平显著低于二倍体(P<0.01).综合分析研究结果表明,在IGFBP-1基因主要表达的肝脏组织中,其mRNA表达水平与DNA甲基化水平呈负相关,启动子区较高的甲基化可能抑制了二倍体泥鳅IGFBP-1基因的表达.

关键词：泥鳅、二倍体、四倍体、IGFBP-1、DNA甲基化、生物多倍化、多倍体鱼类、表型变异、基因表达变异

所属期刊栏目：38

分类号：Q959.46+8(动物学)

资助基金：国家重点研发计划"蓝色粮仓科技创新"重点专项2018YFD0900205

在线出版日期：2019-08-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：9-16