利用滑动窗口和 KNN 算法识别差异甲基化区域

摘要：

针对现有差异甲基化区域 DMRs 识别方法中过度删除显著性弱的甲基化位点、DMRs 长度受限以及不能直接处理多类的问题，提出了一种利用滑动窗口和 KNN 算法识别不同类别间DMRs 的算法.算法先通过滑动窗口结合 KNN 分类器筛选候选区域，再根据误差率合并候选区域得到 DMRs.真实数据上的实验表明，算法的分类性能、聚类指数明显优于对照算法，扩展了对照的 Ong 算法识别的 DMRs 长度，并能发现 Ong 算法未发现的 DMRs.

关键词：差异甲基化区域、滑动窗口、KNN 分类器、多类问题、聚类指数

所属期刊栏目：36

分类号：TP391.4(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金资助项目60903086

在线出版日期：2016-07-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：35-39