仿刺参疣足数量SNP遗传力评估

摘要：

随着测序技术的发展,基于单核苷酸多态性(SNP)分子标记的遗传力估计比传统法准确性更高,已被广泛应用于动植物育种中.本研究对不同地理仿刺参(Apostichopus japonicus)群体的疣足数量进行重测序全基因组水平的SNP遗传力估计,结果显示,次等位基因频率(Minor allele frequency,MAF)>0.05时,在50K SNP基础上均匀抽样,不同SNP密度的仿刺参疣足数量SNP遗传力估计均值范围为(0.566±0.022)～(0.612±0.003);MAF>0.1时,SNP遗传力估计均值范围为(0.586±0.015)～(0.615±0.016),说明50K低密度SNP标记足够捕获数量性状基因座(QTL)大效应和小效应;同时,染色体水平SNP遗传力估计值显示,单个染色体对遗传力的贡献和其长度显著相关,暗示仿刺参疣足数量是一个复杂的数量性状,与该性状相关的基因效应位点散布在各染色体,并由多基因共同作用.本研究结果可为海参低密度SNP芯片的设计开发及海参遗传参数评估提供一定的理论依据.

关键词：遗传力、REML、SNP、仿刺参、疣足数量

所属期刊栏目：42

分类号：Q38(动物遗传学)

资助基金：国家重点研发计划课题;国家自然科学基金项目

在线出版日期：2021-05-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：68-76