基于MSAP技术的刺参选育群体基因组表观与序列遗传多样性分析

摘要：

抗逆选育引起的遗传变化不仅源于DNA序列的变化,也有来自于表观层面的修饰改变.为探究刺参(Apostichopus japonicus)耐高温新品系育种过程中的选育基础群体与选育群体的遗传多样性,运用MSAP技术分析了选育基础群体F、选育F1代和选育F4代的基因组遗传多样性.结果显示,10对引物获得的806个位点中,多态性位点为698个,多态性百分比达到86.60％;基于非甲基化位点的遗传分析,选育F4代香农多态性指数为0.3981,Nei基因多样度为0.2264;基于甲基化敏感位点分析,选育F4代香农多态性指数为0.5873,Nei基因多样度为0.2598,均高于基础群体;表观遗传多样性均大于非甲基化位点变异产生的序列遗传多样性,表明表观变异出现频率高于序列遗传变异.MSAP甲基化模式分析显示,选育F1和F4代经过选育后获得了一些甲基化水平和模式的改变,说明经温度胁迫选育,改变了刺参群体的基因组的甲基化状态.选育F4代获得的类型Ⅱ的条带数最多,为161条,明显高于未选育刺参,为选育获得表观遗传特征.研究结果从遗传物质基础角度揭示了选育群体的遗传改变与进展,可为抗逆新品种选育中的表观遗传研究提供参考.

关键词：刺参、MSAP、DNA甲基化、选育群体、遗传多样性

所属期刊栏目：42

分类号：S968.9(水产养殖技术)

资助基金：国家重点研发计划课题;山东省现代农业产业技术体系;泰山产业领军人才

在线出版日期：2021-05-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：38-45