2016～2017年中国沿海省市虾类偷死野田村病毒(CMNV)分子流行病学调查

摘要：

偷死野田村病毒(CMNV)引起的病毒性偷死病(VCMD)使中国对虾养殖业遭受了严重的经济损失,为查明CMNV及其变异株的分子流行病学特征,本研究采用逆转录套式PCR (RT-nPCR)、逆转录环介导等温扩增(RT-LAMP)和TaqMan实时荧光定量PCR(TaqMan RT-qPCR)3种方法,对2016～2017年中国沿海省市CMNV及一种新型野田村病毒——行动障碍野田村病毒(MDNV)的流行、分布和变异情况进行了分析.结果 显示,养殖凡纳滨对虾、中国明对虾、日本囊对虾、斑节对虾和罗氏沼虾等种类中均可检测到CMNV阳性;在河北、山东、浙江、福建、广东和海南等省市采集的患病对虾中均存在CMNV.基于RT-nPCR、RT-LAMP和TaqMan RT-qPCR的检测结果显示,2016和2017年样品中CMNV的阳性检出率依次分别为11.8％和7.8％,6.7％和3.9％,17.7％和12.4％;基于上述3种方法检测结果计算得出,2016和2017年样品中CMNV的阳性检出率分别为26.8％和16.3％;基于RT-LAMP的分析显示,2016年样品中MDNV的阳性检出率为9.4％.本研究表明,中国沿海省市养殖虾类中VCMD的流行和危害仍不容忽视,RNA依赖的RNA聚合酶基因不断变异导致前期基于该基因开发的CMNV检测方法可靠性下降,检出假阴性风险升高;同时,发病对虾中出现了新的野田村病毒株系且具有较高的流行率,其传播危害风险值得高度关注.

关键词：偷死野田村病毒、分子流行病学调查、逆转录套式PCR、逆转录环介导等温扩增、TaqMan实时荧光定量RT-PCR、行动障碍野田村病毒

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分类号：S945.1(水产保护学)

资助基金：国家自然科学基金面上项目31672695;国家重点研发计划项目2017YFC1404503;中国水产科学研究院黄海水产研究所基本科研业务费项目20603022015003,20603022018008

在线出版日期：2019-04-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：65-73