期刊专题

10.11758/yykxjz.20160322003

海蜇(Rhopilema esculentum)Notch基因的cDNA克隆和表达

引用
基于转录组454 GS FLX测序结果,利用RACE和RT-PCR技术克隆了海蜇(Rhopilema esculentum) Notch基因的cDNA全长,并分析了其mRNA在海蜇不同发育阶段的表达差异,以探讨Notch基因对海蜇无性生殖的影响.结果显示,海蜇Notch基因的cDNA全长为6768 bp,包括90 bp的5'非编码区、6066 bp的开放阅读框及612 bp包含AATAAA加尾信号的3'非翻译区.SMART分析表明,海蜇Notch为分泌蛋白,其信号肽由21个氨基酸组成.成熟肽由2000个氨基酸组成,包括37个结构域、26个表皮生长因子样结构域、3个富含半胱氨酸的Notch/Lin-12(NL)结构域、1个NOD结构域、1个NODP结构域、1个跨膜结构域和6个锚蛋白结构域ANK,并含有25个N-糖基化位点.同源分析表明,海蜇Notch与来自刺胞动物门的海葵(Nematostella vectensis)的Notch相似性为39%,与无脊椎动物和脊椎动物的氨基酸相似度分别为35%-37%和34%-38%.RT-PCR分析表明,Notch基因在海蜇无性繁殖的4个发育时期均有表达,螅状体阶段的表达量最高,横裂体阶段表达量最低,螅状体的表达量是横裂体的1.85倍.这些研究结果为进一步研究Notch信号通路在海蜇无性繁殖中的调控作用奠定了基础.

海蜇、Notch、cDNA、实时荧光定量PCR

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Q71(生物大分子的结构和功能)

国家自然科学基金项目31372507;青岛海洋科学与技术国家实验室鳌山科技创新计划项目2016ASKJ02;中央级公益性科研院所基本科研业务费项目20603022016001共同资助[This work was supported by the National Natural Science Foundation of China31372507;the Aoshan S&T Innovation Project from Qingdao National Laboratory of Marine Science and Technology2016ASKJ02;the Central Public-Interest Scientific Institution Basal Research Fund 20603022016001]

2017-08-31(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

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渔业科学进展

1000-7075

37-1466/S

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2017,38(4)

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国家重点研发计划“现代服务业共性关键技术研发及应用示范”重点专项“4.8专业内容知识聚合服务技术研发与创新服务示范”

国家重点研发计划资助 课题编号:2019YFB1406304
National Key R&D Program of China Grant No. 2019YFB1406304

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