中国对虾SRAP分子标记体系正交优化及在遗传多样性分析中的应用

摘要：

利用正交设计L16(45)对影响中国对虾SRAP分子标记分析的5个因素(Taq酶,Mg2+,模板DNA,dNTP和引物浓度)在4个水平上进行了优化,筛选出各反应因素的最佳水平为:20 μl反应体系中包含1.0 U Taq酶,2.0 mmol/L的Mg2+,40.0 ng的模板DNA,0.125 mmol/L的dNTP以及0.4 μmol/L的引物,退火温度为53.5 ℃.研究表明,各因素的不同水平对扩增结果有显著影响,其中Mg2+影响最大,影响大小顺序依次为Mg2+,Taq酶,引物,dNTP和模板DNA.利用优化的SRAP分子标记体系对中国对虾"黄海1号"第12世代选育群体进行了遗传多样性分析,实验结果表明,此标记技术可作为中国对虾遗传分析的良好技术工具.遗传多样性分析共筛选出8对可以扩增出清晰稳定条带的引物组合,共获得171个位点,其中多态性位点154个,占90.08%;有效等位基因数为1.774 1,期望杂合度均值为0.421 9,Shannon多样性指数为0.605 5.上述参数值均高于应用AFLP技术对前几代选育群体的遗传多样性分析结果.

关键词：中国对虾、正交设计、SRAP、遗传多样性

所属期刊栏目：31

分类号：S966(水产养殖技术)

资助基金：国家科技支撑计划专题2006BAD01A13;国家自然科学基金课题40706052;公益性行业专项nyhyzx07-042;国家虾产业技术体系nycytx-46

在线出版日期：2011-04-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：43-53