基于虚拟筛选和分子动力学模拟发现新型ULK1抑制剂

摘要：

Unc-51样自噬激活激酶1(ULK1)作为自噬启动的重要调控因子,是肿瘤治疗的关键靶点之一.首先,以已知ULK1抑制剂为基础构建药效团模型,通过药效团模型筛选、分子对接以及分子力学广义波恩表面积(MM/GBSA)结合自由能计算等方法,对含有52万多个类药性小分子的数据库进行虚拟筛选,得到具有较高理论亲和力的化合物.随后,50ns的分子动力学模拟验证了蛋白质-配体复合物结合的稳定性,最后10ns的平均结合自由能的计算研究进一步验证了配体的结合能力.结果表明,6个化合物(F5258-0159、F3407-0428、F0529-1100、F0696-3531、F3222-5280、F6525-5596)具有骨架新颖、分子对接分数和结合自由能数值优异及与ULK1的结合状态稳定等特点,可以作为新型潜在的ULK1抑制剂用于肿瘤治疗的研究,也为新型ULK1抑制剂的设计和研发提供新的研究思路.

关键词：ULK1抑制剂、药效团模型、分子对接、分子动力学模拟

所属期刊栏目：87

分类号：R914.2;O641;S153.2

资助基金：河北省自然科学基金C2020209081

在线出版日期：2024-02-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：92-97