转录因子在食管鳞癌基因表达中的调控作用
目的:研究食管鳞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)中转录因子的调控作用.方法:从GEO下载两个基因数据集,利用BRB-ArrayTool分析食管癌细胞和正常细胞之间差异基因表达.从差异表达基因中富集出转录因子,根据转录因子目的基因、结合蛋白和差异基因的相互作用来分析其调控作用.结果:根据463个差异表达基因富集了8个转录因子,差异基因中含此8个转录因子的110个调控基因,包括靶基因、和靶基因相互作用基因及其上游的酶基因.这些基因参与了许多的生物过程,如细胞周期、有丝分裂、细胞分离、细胞转移、DNA的损伤反应和DNA的修复.其中37个基因参与了KEGG信号通路,包括癌化途径、黏着斑、细胞周期、细胞外基质受体相互作用、小细胞肺癌、卵母细胞减数分裂、P53信号通路和脂肪酸代谢通路等.这110个基因和463个差异表达基因参与的信号通路没有明显的差异.这110个基因相互作用,形成有110个节点和316条边组成分子网路.结论:在ESCC中,8个转录因子通过调控其靶基因和相互作用基因而发挥重要作用,其调控基因组成一个复杂的相互作用分子网络.
转录因子、基因芯片、食管癌、分子网络
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国家自然科学基金资助项目,No.81173177;河南省教育厅自然科学基金资助项目,No.2010B360004;河南中医学院科技创新人才基金资助项目,No.2010XCXRC02;:the National Natural Science Foundation of China,No.81173177;the Foundation of Education Department of Henan Province,No.2010B360004;the Science & Technology Innovation Talent Foundation of Henan University of Traditional Chinese Medicine,No.2010XCXRC02
2013-08-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共6页
1533-1538
