大鼠短间隔连续部分肝切除中再生肝的基因表达差异

摘要：

目的:鉴定0-36-40-44 h大鼠短间隔连续部分肝切除(0-36-40-44 h SISPH)中与肝再生有关的基因,并分析他们在肝再生中的表达动态和作用.方法:从0-36-40-44h SISPH再生肝消减cDNA文库中筛选与肝再生有关的基因,用基因芯片技术分析其在肝再生中的表达动态,并用GeneMath软件对有关基因进行聚类分析.结果:用基因芯片技术分析的551个与肝再生有关基因中,157个基因至少在肝再生的一个时间点表达变化达2倍以上,其中,上调表达的基因有87个,下调表达的基因有70个;157个基因中的71个属未报道的基因,86个为已报道基因,但在此之前尚不清楚他们与肝再生有关;聚类分析和统计学分析表明,0-36-40-44 h SISPH的基因表达模式分为6类,即早期诱导,中期诱导,晚期诱导,早期抑制,中期抑制,晚期抑制.与PH相比,38个基因在0-36-40-44 h SISPH中特异性表达,119个基因在这两个模型中表达趋势相同,但在各时间点的表达丰度不同.结论:0-36-40-44 h SISPH中,上调和下调表达的基因数目相差不大;晚期表达的基因多于早期表达的基因,远多于中期表达的基因;表达幅度小的基因(2-5倍)多于表达幅度大的基因.

机标关键词：大鼠、短间隔连续部分肝切除、再生肝、基因芯片、表达差异、partial hepatectomy、肝再生、下调表达、聚类分析、技术分析、表达动态、时间点、特异性表达、早期抑制、上调表达、基因数目、基因表达、表达丰度、表达变化、统计学

所属期刊栏目：12

分类号：Q81(生物工程学(生物技术))

资助基金：国家自然科学基金30270673;国家重点实验室基金030001

在线出版日期：2006-07-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：654-663