丙型肝炎病毒非结构蛋白NS5A反式激活基因NS5ATP5的克隆

摘要：

目的:应用抑制性消减杂交技术及生物信息学技术筛选并克隆丙型肝炎病毒非结构蛋白5A(HCV NS5A)反式激活新型靶基因.方法:以HCV NS5A表达质粒pcDNA3.1(-)-NS5A转染HepG2细胞,以空载体pcDNA3.1(-)为平行对照,提取mRRNA并进行抑制性消减杂交(SSH)分析.对于所获基因片段序列分析表明,其中之一为新型基因片段,与GenBank中注册的已知功能基因序列没有同源性,利用表达序列标签(EST)序列的搜索和比对,进行电子拼接,根据基因起始密码子的Kozak规则和终止密码子下游保守的多聚腺苷酸信号序列,确定新型基因序列.从HepG2细胞提取总RNA,以逆转录多聚酶链反应(RT-PCR)技术扩增获得该新基因的全长序列,并测序证实.结果:NS5ATP5基因的编码序列全长为1 191个核苷酸(nt),编码产物由396个氨基酸残基(aa)组成.命名为NS5ATP5,在GenBank中注册,注册号为AF529366.结论:HCV NS5A反式激活新型靶基因NS5ATP5的筛选与克隆,为进一步研究HCV NS5A反式激活作用的分子生物学机制和探索新型治疗技术奠定基础.

机标关键词：丙型肝炎病毒、非结构蛋白、反式激活、激活基因、克隆、hepatitis C virus、nonstructural protein、抑制性消减杂交技术、基因序列、基因片段序列、生物信息学技术、注册、多聚酶链反应、表达序列标签、靶基因、终止密码子、生物学机制、起始密码子、治疗技术、信号序列

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分类号：R511(传染病)

资助基金：国家自然科学基金C03011402,C30070689;军队科技攻关项目98D063;军队杰出人才基金98H038;军队科技攻关项目01Q138;军队科技攻关项目01MB135

在线出版日期：2006-07-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1901-1904