构象敏感凝胶电泳快速检测HBV准种序列异质性的方法

摘要：

目的:建立一种快速检测乙型肝炎病毒(HBV)准种遗传异质性的方法并验证其敏感性和特异性.以满足研究HBV准种需要检测大量病毒序列的要求.方法:在构象敏感凝胶电泳(CSGE)检测方法的基础上,针对HBV核酸序列组成的特殊性,调整凝胶中使用的甲酰胺和乙二醇浓度并加入一定量的尿素,另外通过一次预电泳优选驱动序列.最后用改进地CSGE检测已知序列的HBV C-ORF区片段克隆,并把检测结果与DNA序列分析结果进行比对,验证该方法的敏感性和特异性.结果:用改进地CSGE检测克隆的HVC C-ORF区片段获得了清楚地电泳图谱.对已知序列的HBC C-ORF区克隆片段进行检测:在34个克隆中发现了27种不同的克隆型,准种内病毒株(克隆)频率介于2.9～17.6%,克隆型之间的遗传距离介于0.2～2%.CSGE所得结果与DNA序列分析结果高度一致.结论:我们建立的CSGE具有高度的敏感性和特异性,完全可以用于检测HBV准种序列的异质性及其他相关研究

机标关键词：构象敏感凝胶电泳、快速检测、遗传异质性、检测方法、gel electrophoresis、hepatitis B virus、敏感性和特异性、克隆型、序列分析、乙型肝炎病毒、乙二醇浓度、遗传距离、验证、相关研究、驱动序列、片段克隆、核酸序列、高度一致、电泳图谱、甲酰胺

所属期刊栏目：10

分类号：R4(临床医学)

在线出版日期：2006-07-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：411-414