基于BSA-seq的拟南芥辐射诱变突变体的基因定位

摘要：

辐射诱变极易导致染色体结构变异,目前鲜有采用BSA-seq方法定位辐射诱变突变体基因的研究报道.为探索BSA-seq用于辐射诱变突变体的基因定位的可行性,本研究通过辐射诱变筛选得到一个拟南芥突变体,将其与亲本杂交,在F2代分离群体中根据表型筛选单株,构建两个极端表型的子代混池;将两个子代混池与亲本混池进行全基因组测序,使用MutMap、QTL-seq和GPS等多种BSA-seq定位策略对其进行定位分析.结果表明,多种BSA-seq定位策略均取得了一致的结果,在2号染色体上获得7 Mb的初步定位区间;使用IGV软件对该区间内的基因组进行可视化,发现该区间内存在25 189 bp的大片段缺失,缺失区段包含6个基因;通过SnpEff进行突变位点注释,经基因注释信息推测AT2G28610为候选基因;通过遗传学试验验证了该候选基因为突变基因.本研究结果为应用BSA-seq技术定位辐射诱变得到的突变位点提供了参考.

关键词：拟南芥、辐射诱变、基因定位、BSA-seq

所属期刊栏目：37

分类号：S511;Q943.2;R733.7

资助基金：国家自然科学基金32270867

在线出版日期：2023-09-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1905-1911