毛竹PhcircRNA1的鉴定和调控通路分析

摘要：

环状RNA(circRNAs)是一类经过反向剪切后,3'末端和5'末端共价结合形成的闭合环状单链非编码RNA,在环境胁迫下对植物生长发育有着重要调控作用.为探索circRNA在毛竹响应胁迫过程中的调控作用,本研究构建了 circRNA-miRNA-mRNA调控通路.在分析毛竹的全转录组测序数据后,选择并鉴定了 1个在紫外线胁迫(UV)和高温胁迫(42℃)下均差异表达的circRNA(PhcircRNA1),并利用生物信息学分析其调控的miRNA和靶基因.通过核糖核酸酶R(RNaseR)法鉴定其转录的稳定性,并通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法分析了 PhcircRNA1、靶miRNA(Ph-miR 156)和靶mRNA的表达特征.本研究进一步选择GLR3.1(Glutamate Receptor-Like Gene 3.1)靶基因作为研究对象,观察毛竹水培苗根尖生长至1 cm后的circRNA-miRNA-mRNA表达调控趋势.结果表明,在UV胁迫和高温胁迫下,PhicircRNA1和靶mRNA表达量都有明显下降趋势,而miRNA表达量增高.在毛竹根尖细胞中,PhcircRNA1和GLR3.1表达量变化一致,和Ph-miR156相反.结果表明PhcircRNA1可能通过竞争性内源RNA(ceRNA)机制参与毛竹非生物胁迫响应,并在毛竹生长发育中起重要作用.本研究为进一步研究PhcircRNA1的功能奠定了理论基础.

关键词：PhcircRNA1、miRNA、GLR3.1(Glutamate Receptor-Like Gene 3.1)、毛竹根尖

所属期刊栏目：37

分类号：R285.5;R734.2;S831

资助基金：国家自然科学基金;浙江自然科学基金重点项目

在线出版日期：2023-03-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：680-689