番茄PLC基因家族鉴定及抗番茄褐色皱果病毒(ToBRFV)防御反应分析

摘要：

番茄褐色皱果病毒(ToBRFV)被我国列为检疫性病毒,严重威胁番茄的安全生产.为了明确番茄磷脂酶C(PLC)的种类,探究番茄PCL在植株抗ToBRFV防御反应过程中的潜在作用.本研究首先基于生物信息学鉴定了 10个番茄PLC家族成员,其中特异性磷脂酶C(PI-PLC)7个,非特异性磷脂酶C(NPC)3个,7个PI-PLC蛋白均具备3个核心结构域(PLC_X c、PLC_Y c、C2)和1个EF_hand-like结构域,3个NPC蛋白均只具有Phosphoesterase结构域.10个番茄PLC蛋白按照结构相似度可以划分为7个分支,分别为 NPC1、NPC2、NPC6、PI-PLC2、PI-PLC3、PI-PLC4、PI-PLC6.另外,10 个番茄 PLC 蛋白的二级结构占比类似,但三级结构存在明显差异.共线性分析结果显示,番茄PLC基因与水稻、拟南芥、雷蒙德式棉PLC基因间分别存在3、12、16对共线性关系.最后,通过转录组测序方法,检测了 PLC基因家族在接种ToBRFV后的相对表达水平,结果显示,SlNPC1、SlNPC6、SlPLC4在ToBRFV接种的样本中表达水平较高,其他PLC基因则在ToBRFV接种后表达水平降低.本研究为番茄抗ToBRFV研究和育种奠定了技术与理论基础.

关键词：番茄、PLC基因家族、生物信息学、抗病毒、ToBRFV

所属期刊栏目：37

分类号：Q949.748.3;TU392;TU444

资助基金：贵州省省级科技计划项目;国家自然科学基金;贵州大学培育项目

在线出版日期：2023-03-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：230-240