两个柑橘品种内生细菌富集方法的筛选

摘要：

为探究不同预处理对柑橘内生细菌的富集效果,本研究以脐橙和蜜柑的叶片与果皮为材料,通过对其内生细菌基因组DNA提取和Illumina测序,比较分析了3种富集内生细菌的方法.结果表明,与对照相比,3种方法均能有效富集内生细菌.样品组织经A处理(1.5％离析酶R-10+1.5％纤维素酶R-10 +8.55％蔗糖)、B处理(1.5％离析酶R-10+1.5％纤维素酶R-10+12.8％甘露醇+0.12％MES+ 0.36％ CaCl2·2H2O+ 0.011％ NaH2PO4)和C处理(8.55％蔗糖)处理后,植物叶绿体DNA占宏基因组DNA的比例均有所降低,其中脐橙叶片和蜜柑果皮经过A处理效果最佳,分别为7.34％、74.89％;脐橙果皮和蜜柑叶片经过B处理效果最佳,分别为36.07％、9.65％;与对照相比,经3种处理能增加OTU分类单元数量,增加变形菌门和厚壁菌门细菌的含量,可获得更多内生细菌种类.由此可知,3种方法在内生细菌富集中均有一定的效果,其中A和B处理最佳,使内生细菌能够更好地被富集,有效减少了柑橘叶绿体DNA的干扰.本试验结果为柑橘及其他植物内生细菌的富集方法和相关研究提供了理论参考.

关键词：温州蜜柑、纽荷尔脐橙、内生细菌、富集方法

所属期刊栏目：32

资助基金：国家自然科学基金项目31460139

在线出版日期：2018-04-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：266-273