猪繁殖与呼吸综合征病毒感染Marc-145细胞的长链非编码RNA和mRNA转录组分析

摘要：

为了挖掘猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)感染Marc-145细胞后宿主细胞长链非编码RNA(lncRNA)和mRNA表达谱的变化,对PRRSV感染Marc-145细胞的lncRNA和mRNA进行转录组测序和分析.生物信息学分析结果显示,PRRSV感染后Marc-145细胞有39个差异表达lncRNA(DElncRNA)和1 320个差异表达mRNA(DEG).进一步的富集分析结果显示,这些DElncRNA和DEG主要富集在氧化磷酸化信号通路.DElncRNA和DEG的联合分析结果显示,与lncRNA共表达的mRNA主要富集在MAPK信号通路、胰岛素信号通路、神经营养素信号通路、AMPK信号通路、HIF-1信号通路、内质网中的蛋白质加工和碳代谢相关的信号通路,这些通路主要与宿主免疫有关.综上,PRRSV感染导致Marc-145 细胞的 lncRNA 和 mRNA 表达谱均发生 了改变,经生物信息 学分析,推测差异表达产 物可能在宿主对PRRSV感染的先天免疫反应中发挥重要作用.

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒、长链非编码RNA、mRNA、Marc-145细胞、转录组

所属期刊栏目：52

分类号：S855.3(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金;河南省高等学校重点科研项目;河南省重点科技攻关项目

在线出版日期：2023-05-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：127-136