甜瓜SnRK2基因家族的鉴定与特征分析

摘要：

蔗糖非发酵型蛋白激酶2(Sucrose non-fermenting-1-related protein kinase2,SnRK2)是一类具有丝氨酸/苏氨酸特定结构域的蛋白质磷酸化酶,在ABA信号介导和非生物胁迫应答方面起到重要作用.以甜瓜为研究对象,使用生物信息学分析方法,对甜瓜SnRK2基因家族进行鉴定及相关特征分析,包括构建系统发育进化树,以及基因理化性质、基因结构及保守结构域、染色体定位、共线性分析、基因的上游顺式作用元件及转录组数据热图分析等,为甜瓜SnRK2基因的功能分析和研究奠定一定的理论基础.结果表明,在甜瓜基因组中共鉴定出9个SnRK2基因家族成员.主要定位在细胞骨架中,以α-螺旋和不规则卷曲为主,分子质量为31.49～75.02ku,等电点为4.42-6.21.其可分为3个亚族,分布在4条染色体上.启动子分析结果显示,在甜瓜SnRK2基因的调控序列中有多个植物激素和逆境胁迫相关响应元件.组织表达分析结果表明,有些甜瓜SnRK2基因在不同组织中呈组成型表达,有些基因则具有显著的组织特异性.

关键词：甜瓜、SnRK2基因家族、鉴定、系统进化分析、生物信息学

所属期刊栏目：51

分类号：S652(瓜果园艺)

资助基金：新疆生产建设兵团重点项目0155/KZ0118

在线出版日期：2022-08-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：108-116