基于全基因组测序构建水稻RIL群体遗传图谱

摘要：

[目的]以籼稻品种'MDS'和'R315'为亲本,构建一张高密度的遗传图谱,挖掘水稻Oryza sativaL重要农艺性状相关基因并加快水稻品种选育.[方法]对两亲本及其192个重组自交系(RILs)群体进行全基因组测序,筛选高质量单核苷酸多态性(SNPs),划分bin标记,针对每个连锁群使用JoinMap4.0对bin标记进行排序,用perl SVG模块绘制连锁图,并对标记在基因组和遗传图谱上的位置进行共线性分析.[结果]两亲本间共筛选出221 494个高质量SNPs,构建了一张高密度遗传图谱,包含1 612个bin标记,总图距为1 327.82 cM,相邻标记间平均遗传图距为0.82 cM.共线性分析显示各连锁群上的大部分标记顺序与基因组保持…致,共线性较好,图谱质量高.[结论]本研究构建的高密度遗传图谱质量较高,为后续功能基因的鉴定提供了基础.

关键词：水稻、重组自交系、全基因组测序、遗传图谱

所属期刊栏目：42

分类号：Q37(植物遗传学)

资助基金：国家重点研发计划;国家自然科学基金;广东省重点领域研发计划

在线出版日期：2021-04-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：44-50