结核性胸膜炎微小RNA表达谱和诊断标志物鉴定

摘要：

目的 探索结核性胸膜炎(tuberculous pleurisy,TP)患者胸腔积液差异表达微小核糖核酸(microRNA,miRNA)及其与自噬的关系.方法 选取作者医院就诊的10例TP患者(病例组)和10例其他胸腔积液患者(对照组),进行胸水总RNA提取、miRNA测序分析,以检测miRNAs表达谱的差异表达;进一步选取同期就诊的20例TP患者和20例非TP患者的胸腔积液验证miRNAs表达谱.通过逆转录聚合酶链反应(reverse transcription polymerase chain re-action,RT-PCR),受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析,真实性评价证实了其中6个表达不同的miRNAs的诊断意义.选取miR-21-5p预测其自噬相关基因之间、自噬蛋白之间的互作关系.结果 芯片系统分析筛选出差异表达miRNAs 73个.RT-PCR结果显示,与对照组比较,miR-3148、miR-4701-3p在病例组中上调;miR-223-3p、miR-23a-3p、miR-7a-5p、miR-21-5p 在病例组中下调.ROC 曲线结果显示,miR-7a-5p、miR-23a-3p、miR-21-5p、miR-223-3p、miR-3148、miR-4701-3p对 TP 的诊断性能曲线下面积(area under the curve,AUC)分别为 0.787、0.944、0.832、0.878、0.919、0.732.通过生物信息学分析同时结合人类自噬调节数据库(Human Autophagy Moderator Data-base,HAMdb)进行预测,显示与miR-21-5p相关度最高的前5位基因分别是BECN1、MAPK1、FOXO3、HSPA8和RAB11A.结论 结核性胸腔积液(tuberculous pleural effusion,TPE)中的miRNAs对TP有一定诊断价值,其中6个miRNAs为诊断治疗TP提供了新的标志物和潜在的治疗靶点,并且推测miR-21-5p可能通过自噬相关基因来调节自噬,影响TP的发病过程和结局,值得进一步研究.

关键词：结核病、结核性胸膜炎、微小核糖核酸、诊断标志物、生物信息学

所属期刊栏目：38

分类号：R521.7(结核病)

资助基金：国家重点实验室开放基金SKL-HIDCA-2021-29

在线出版日期：2024-08-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：573-578,583