基于癌症基因组图谱数据库的结直肠腺癌加权基因共表达网络的构建与分析

摘要：

目的 利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库结直肠腺癌组织样本表达谱数据,筛选差异表达的基因及微小RNA(miRNA),构建结直肠癌加权基因共表达网络,分析预后相关基因及miRNA.方法 首先在TCGA数据库下载结直肠腺癌组织样本表达谱数据,应用生物信息学原理探索并分析差异表达基因及miRNA,构建加权基因共表达网络,筛选其枢纽基因及相关miRNA,进而发现预后相关枢纽基因及miRNA.结果 共发现2个核心网络,结合2个核心网络的top10枢纽基因及相关miRNA,进一步确定了和预后相关的基因及miRNA,分别为CYP2E1和mir-885.结论 构建结直肠癌加权基因共表达网络可为研究结直肠癌的潜在发病机制提供了参考,枢纽基因及相关miRNA有可能作为诊断的生物标志物和治疗靶点应用于临床.

关键词：结直肠癌、加权基因共表达网络、枢纽基因、微小RNA

所属期刊栏目：39

分类号：R735.3(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金81802434

在线出版日期：2018-11-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：402-405