基于网络药理学和数据分析方法研究中药调控冠心病发展的铁死亡关键基因

摘要：

目的 运用网络药理学和数据分析的方法筛选中药调控冠心病发展的铁死亡关键基因.方法 通过FerrDb数据库和文献检索查找铁死亡相关基因,利用OMIM、GeneCards、DurgBank、Disgenet数据库筛选冠心病相关的疾病基因,并取二者的交集基因,并利用STRING数据库和Cytoscape 3.8.2软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,利用拓扑学分析得到Degree值排名前20的"铁死亡-冠心病"关键基因.利用Matescape平台进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,R软件制作气泡图和柱状图.通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、UniProt数据库和频数分析得到含有"铁死亡-冠心病"关键基因的关键中药,并利用Cytoscape 3.8.2软件构建"中药-成分-靶点"网络图,利用STRING数据库和Cytoscape 3.8.2软件构建"中药-冠心病"PPI网络,利用拓扑学分析得到Degree值排名前10的"中药-冠心病"核心基因,并对2次得到的核心基因取交集,最终得到中药调控冠心病发展的铁死亡关键基因.结果 共获得259个铁死亡相关基因靶点,955个冠心病疾病基因,161个"铁死亡-冠心病"交集基因,20个"铁死亡-冠心病"关键基因.铁死亡在冠心病发展中主要涉及氧化反应和炎症反应,涉及的通路主要为流体剪应力和动脉粥样硬化通路、自噬相关通路及铁死亡通路.获得含有"铁死亡-冠心病"关键基因的中药498种,其中麻黄、芫荽、余甘子、黄芩、丹参、青蒿、葛根包含的关键基因最多,最终得到中药调控冠心病发展的铁死亡关键基因8个,即TP53、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、白细胞介素6(IL-6)、信号转导和转录激活因子3(STAT3)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、丝裂原激活蛋白激酶1(MAPK1)、MAPK3、MAPK8.结论 中药从铁死亡途径调控冠心病的关键基因为TP53、PTGS2、IL-6、STAT3、VEGFA、MAPK1、MAPK3、MAPK8.

关键词：冠状动脉疾病、数据挖掘、网络药理学、中医药、铁死亡基因

所属期刊栏目：44

分类号：R541.4;R285(心脏、血管（循环系）疾病)

资助基金：安徽中医药大学校级探索性科研项目2021zxts43

在线出版日期：2022-10-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1188-1195