VNN1基因在急性髓系白血病中的表达及临床意义

摘要：

目的 通过在线数据库挖掘分析VNN1基因在急性髓性白血病(acute myeloid leukemia,AML)中的表达并探讨其临床意义.方法 使用癌症基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)、组织特异性基因表达库(the genotype-tissue expression,GTEx)和高通量基因表达数据集(gene expression omnibus,GEO)等数据库分析 VNN1基因在AML患者和正常对照组中的表达水平;通过下载TCGA、GEO数据集中AML患者的数据信息,进行VNN1基因表达水平与临床特征及总体生存期的相关性分析;利用STRING数据库分析VNN1蛋白-蛋白互作网络,并进行GO基因富集和KEGG通路富集分析,通过单样本基因集富集分析(ssGSEA)来评估VNN1与免疫细胞浸润之间的相关性.结果 与健康对照组(0.025±0.053)相比,VNN1在AML中显著高表达(3.306±1.991)(P＜0.001),且其表达水平与AML患者细胞遗传学风险、FLT3突变状态、NPM1突变状态存在密切关系(P＜0.05);ROC曲线表明VNN1的表达水平可以准确区分正常人群和AML患者(曲线下面积为0.969);生存分析结果显示VNN1低表达的AML患者中位生存期为27.4个月,而高表达组中位生存期只有10.1个月,差异有统计学意义(P＜0.001).单因素和多因素COX回归分析均表明高表达的VNN1是AML总体预后的独立危险因素(风险比分别为1.998,1.763)(P＜0.05);STRING数据库显示与VNN1相互作用的蛋白有PANK1、PANK3、PANK2、VNN2、VNN3、SERPIN2、TAAR2、T A AR5、TA AR1、STX7.GO 功能及 KEGG 信路通路的富集分析显示VNN1主要参与的生物学过程包括囊泡运输中的核心蛋白复合体相互作用、泛酸和辅酶A生物合成、补体和凝血级联反应过程、血小板活化等.结论 通过对在线数据库进行挖掘分析发现,VNN1在AML中显著高表达且与患者总体生存期呈负相关,为进一步深入研究AML发病机制和靶向治疗提供了理论依据.

关键词：急性髓系白血病、预后标志、免疫浸润

所属期刊栏目：43

分类号：R552(血液及淋巴系疾病)

在线出版日期：2023-03-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1390-1396,1438