GJB6和PRKAA1基因多态性及其与槐山羊产羔数的关联分析

摘要：

为探究GJB6 和PRKAA1 基因对槐山羊繁殖性能的影响,以122 只不同产羔数的槐山羊群体为研究对象,参照NCBI数据库中山羊GJB6 和PRKAA1 基因参考序列设计引物,利用PCR与测序技术扫描GJB6 和PRKAA1 基因单核苷酸多态性(SNP),并进行遗传多态性、群体遗传参数分析和基因型与产羔数的关联分析.结果表明,在GJB6 基因中检测到2 个SNP位点:g.50694819 C>T和g.50694816 T>C,均为同义突变;在PRKAA1 基因中检测到3 个SNP位点:g.33691489 T>C、g.33693395 A>T和g.33693100 T>C,均位于非编码区.GJB6 基因g.50694819 C>T位点和PRKAA1 基因g.33693100 T>C位点为低度多态;GJB6 基因g.50694816 T>C位点、PRKAA1 基因g.33691489 T>C和g.33693395 A>T位点为中度多态.卡方检验结果表明,5 个SNP位点均处于Hardy-Weinberg平衡.基因型与产羔数的关联分析结果表明,GJB6 基因2 个SNP的各个基因型间槐山羊产羔数的差异不显著,不适用于槐山羊群体的多羔性状选育.PRKAA1 基因g.33691489 T>C位点的TC基因型个体产羔数显著高于CC基因型,g.33693395 A>T位点AT基因型个体产羔数显著高于AA、TT基因型(P<0.05),且g.33691489 T>C和g.33693395 A>T位点呈现强连锁平衡状态(D'>0.8,r2>0.33).单倍型关联分析结果显示,PRKAA1 基因TCA单倍型个体的产羔数显著高于CTA、CTT、TTA单倍型个体的产羔数(P<0.05).因此,槐山羊PRKAA1 基因g.33691489 T>C位点TC基因型与g.33693395 A>T位点AT基因型以及TCA单倍型个体具有较高的产羔数,可作为槐山羊产羔数选育的潜在分子标记.

关键词：槐山羊、PRKAA1基因、GJB6基因、SNP、产羔数

所属期刊栏目：38

分类号：S827(家畜)

资助基金：河南省重点研发与推广专项;河南省现代农业产业技术体系建设专项

在线出版日期：2023-09-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：225-232