芸豆盐碱响应NAC转录因子的分子特性分析

摘要：

为进一步揭示芸豆NAC基因在参与调控植物生长发育及应对非生物胁迫反应中的作用,以芸豆耐盐碱品种HYD为试验材料,利用Illumina HiSeq技术,构建了NaHCO3处理和NaCl处理下的芸豆叶片组织转录组.从转录组数据中共筛选出8个盐碱相关NAC转录因子,并对其进行理化性质分析、系统进化发育分析、磷酸化位点预测、蛋白质二级结构预测、启动子元件分析、基因结构分析、染色体定位分析和表达量分析.结果表明:8个芸豆盐碱响应NAC基因分子量在23676.36～44354.33 ku,蛋白编码203～394个氨基酸,等电点在4.74～8.86,其中3个基因编码酸性蛋白,8个蛋白被分为4个亚族(a～d),分列在8个染色体上,包含3个膜结合蛋白,8个蛋白中丝氨酸数量最多,有10～22个,无规则卷曲结构占比最大,在68.0％ ～84.5％,8个蛋白全部定位在细胞核上.在NaHCO3处理下,4个基因为上调表达(log2FC>2),2个为下调表达(log2FC<-2),NaCl处理下,1个为上调表达(log2FC>2),4个为下调表达(log2FC<-2),有3个基因同时响应NaHCO3和NaCl.在8个基因启动子中共发现10个启动子元件,同时每个基因都包含3～7个元件.表明这些基因都可能参与芸豆的逆境应答.

关键词：芸豆;NAC转录因子;生物信息学;盐碱胁迫

所属期刊栏目：36

分类号：S643.1

资助基金：国家重点研发计划;黑龙江省博士后面上基金项目;黑龙江八一农垦大学研究生创新科研项目

在线出版日期：2022-01-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：19-27