基于GEO数据库筛查小鼠缺血性卒中后心脏组织的差异基因

摘要：

目的:分别比较缺血后24 h和72 h大脑中动脉闭塞模型(MCAO)小鼠与假手术(Sham)小鼠左心室的差异基因,分析缺血性卒中后不同时间点的差异基因及其调控的功能通路,以期分析缺血性卒中后诱发心功能障碍的机制并为其治疗提供依据.方法:在美国国立生物技术信息中心(NCBI)的GEO数据库下载MCAO小鼠与Sham小鼠左心室的基因芯片数据;通过R语言软件编程处理,获得差异表达基因;利用DAVID 6.8在线分析工具对获得的差异基因进行GO功能富集和KEGG通路富集分析,并运用Omicshare在线分析工具对富集分析结果进行可视化.结果:缺血后24 h,得到187个差异表达基因,56条具有显著意义的GO富集通路和5条具有显著意义的KEGG富集通路;缺血后72 h,得到51个差异表达基因,14条具有显著意义的GO富集通路和3条具有显著意义的KEGG富集通路.其中,两个时间点均涉及Aplnr、Itgb6两个基因靶点与PI3K?Akt信号通路.结论:本研究通过分析基因表达谱数据,得到缺血性卒中后诱导心功能障碍的差异表达基因及相关通路;PI3K?Akt信号通路与心功能调节密切相关,调节PI3K?Akt信号通路可能是治疗缺血性卒中后并发心功能障碍的重要方向.

关键词：GEO数据库;缺血性卒中;心功能障碍;差异基因;基因芯片

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分类号：R743.3;Q811.4(神经病学与精神病学)

资助基金：宁夏医科大学校级科研项目资助;宁夏医科大学特殊人才启动项目

在线出版日期：2021-12-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1808-1813