重度抑郁症发病机制关键基因和信号通路的生物信息学分析

摘要：

目的:通过生物信息学方法分析与重度抑郁症分子生物学机制相关的关键基因和信号通路.方法:从美国国家生物技术信息中心网站GEO公共数据库获得脑皮质总mRNA表达谱数据(GSE101521),使用Networkanalyst在线数据库筛选正常组(非精神病人)和抑郁组(抑郁症患者)存在表达差异的基因;利用DAVID和KOBAS在线数据库进行GO功能和KEGG信号通路分析;STRING和Cytoscape软件进行PPI分子网络构建.结果:共筛选出41个差异基因,其中39个差异基因上调,2个差异基因下调.GO功能注释富集分析发现差异基因主要参与炎症反应,而KEGG通路分析表明与抑郁相关的最主要通路是IL-17信号通路,TNF信号通路和NOD样受体信号通路.通过蛋白-蛋白互作网络和模块分析筛选出了6个关键基因(IL6,CXCL8,IL1B,FOS,CCL2和CXCL2).结论:本研究筛选出了重度抑郁症涉及免疫系统新的标志物和靶标,其参与了重度抑郁症关键发病机制.

关键词：重度抑郁症;差异基因;信号通路;生物信息学

所属期刊栏目：27

分类号：R749.4;Q811.4(神经病学与精神病学)

资助基金：国家自然科学基金资助项目81973502

在线出版日期：2021-12-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1730-1736