基于生物信息学的银屑病基因集富集及免疫细胞浸润分析

摘要：

目的:基于生物信息学对银屑病表达谱芯片数据进行基因集富集分析(GSEA)和免疫细胞浸润分析,以更深入了解银屑病的发病机制.方法:从GEO数据库中获取GSE6710芯片数据,利用GSEA软件进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;CIBERSOFT官网下载22种免疫细胞基因表达矩阵及R包,运用R软件获取免疫细胞浸润矩阵并绘制相关图形.结果:与细胞增殖、先天免疫相关的通路在银屑病皮损组高表达,一些癌症相关通路在银屑病皮损组高表达.免疫细胞浸润分析显示活化的记忆T细胞、滤泡辅助性T细胞、M0巨噬细胞、活化的树突状细胞在银屑病皮损组中上调,未活化的肥大细胞在银屑病皮损组下调.活化的树突状细胞与滤泡辅助性T细胞呈正相关,活化的肥大细胞与M0巨噬细胞呈正相关.未活化的肥大细胞和活化的记忆T细胞呈负相关,M1巨噬细胞与调节性T细胞呈负相关,M0巨噬细胞和未活化的肥大细胞呈负相关.结论:细胞增殖与先天免疫在银屑病的发病中具有重要意义;免疫细胞浸润分析与目前银屑病发病模型大致符合,巨噬细胞和肥大细胞在银屑病发病中也起着一定作用.

关键词：银屑病;基因集富集分析;免疫浸润;细胞增殖;先天免疫

所属期刊栏目：27

分类号：R758.63(皮肤病学与性病学)

资助基金：银屑病中医临床基础研究北京市重点实验室BZ0375-KF201602

在线出版日期：2021-11-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1652-1658